Obec Vaniškovce sa nachádza na Slovensku v okrese Bardejov, južne od Bardejova v Bartošovskej kotline, na chrbte medzi dolinami Rešovky a Sekčova, 1 km od hlavnej cesty spájajúcej Prešov a Bardejov. Dedina leží takmer v presnej polovici cesty medzi týmito mestami. Chotár obce je v nadmorskej výške od 350 do 445 m (stred obce má 400 m n. m.). Obec je postavená na kopci, takže je viditeľná z okolitých dedín. Dominantou obce je zrekonštruovaný kostol sv. Imricha.